黃錫瑜教授曾經在清華大學開授過六門大學部課程，以及五門研究所課程。 大學部課程包括【邏輯設計】，【資料結構】，【積體電路設計自動化概論】，【電資工程實務概論】，【科技導讀】，【計算機程式設計】。研究所課程包括【積體電路設計】，【積體電路設計自動化】，【超大型積體電路訊號處理】，【積體電路測試】，【時序電路設計與應用】等。